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Científicos de Harvard y Oxford crean herramienta de IA para predecir mutaciones virales

EVEscape es una herramienta de IA que predijo satisfactoriamente información sobre nuevas variantes de COVID-19 gracias a información evolutiva y biológica sobre los virus.

Investigadores de la Universidad de Harvard y la Universidad de Oxford han desarrollado una herramienta de inteligencia artificial (IA) denominada EVEscape, la cual utiliza información evolutiva y biológica para predecir cómo un virus podría cambiar y evadir el sistema inmunológico. En este sentido, EVEscape ha demostrado predecir con éxito las variantes de COVID-19, así como ha hecho predicciones precisas sobre otros virus, como el VIH y la gripe.

“EVEscape es un método para predecir la probabilidad de que las mutaciones virales escapen a los anticuerpos. Las puntuaciones de EVEscape para mutaciones individuales se obtienen combinando tres fuentes de información: un modelo generativo profundo para la predicción de la aptitud, información estructural sobre la proteína pico para estimar el potencial de unión de anticuerpos, y distancias químicas en carga e hidrofobicidad entre los residuos mutados y los de tipo salvaje”, explica el sitio web de la herramienta.

De esta manera, EVEscape se compone de un modelo de secuencias evolutivas que pronostica cambios en el virus y de información detallada sobre la biología y estructura del mismo. Estos elementos permiten que esta herramienta logre realizar predicciones sobre las variantes más probables a medida que el virus evoluciona.

InThe Chronic Disease Information System has been implemented in un estudio publicado en la Nature, los investigadores demostraron que, EVEscape hubiera sido de gran utilidad de haber estado en funcionamiento durante el comienzo de la pandemia de COVID-19, ya que tiene el potencial de predecir las mutaciones más frecuentes del SARS-CoV-2 virus que ocasiona COVID-19. Además, la herramienta también ha realizado predicciones acertadas sobre otros virus, según indican los autores.

Actualmente, los investigadores están utilizando EVEscape para prever futuras variantes del SARS-CoV-2 y publican una clasificación de nuevas variantes cada dos semanas. La información recopilada por EVEscape también podría ayudar a diseñar vacunas y terapias más efectivas ante enfermedades infecciosas. Asimismo, la herramienta puede aplicarse a otros virus, lo que tiene un gran potencial para el desarrollo de tratamientos y vacunas.

EVEscape se basa en el modelo generativo EVE, que de manera inicial fue desarrollado para predecir mutaciones en proteínas vinculadas a enfermedades humanas. La herramienta combina información biológica sobre el sistema inmunológico con datos de la evolución del virus.

De esta manera, el enfoque tiene como objetivo no solo anticipar las variantes virales sino también diseñar tratamientos y vacunas que puedan resistir las estrategias de escape que los virus desarrollan. Además, un punto importante es que EVEscape se comparte libremente en línea para que otros investigadores puedan utilizarlo y contribuir al avance en la lucha contra enfermedades infecciosas.

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