{"id":60525,"date":"2025-10-03T10:18:57","date_gmt":"2025-10-03T16:18:57","guid":{"rendered":"https:\/\/saluddigital.com\/?p=60525"},"modified":"2025-10-03T10:24:17","modified_gmt":"2025-10-03T16:24:17","slug":"giotto-suite-un-ecosistema-para-analizar-datos-espaciales-de-multiples-escalas-y-tecnologias","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/saluddigital.com\/en\/big-data\/giotto-suite-un-ecosistema-para-analizar-datos-espaciales-de-multiples-escalas-y-tecnologias\/","title":{"rendered":"Giotto Suite: un ecosistema para analizar datos espaciales de m\u00faltiples escalas y tecnolog\u00edas"},"content":{"rendered":"<div data-elementor-type=\"wp-post\" data-elementor-id=\"60525\" class=\"elementor elementor-60525\" data-elementor-post-type=\"post\">\n\t\t\t\t\t\t<section class=\"elementor-section elementor-top-section elementor-element elementor-element-5d3fd16 elementor-section-boxed elementor-section-height-default elementor-section-height-default wpr-particle-no wpr-jarallax-no wpr-parallax-no wpr-sticky-section-no wpr-equal-height-no\" data-id=\"5d3fd16\" data-element_type=\"section\" data-e-type=\"section\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-container elementor-column-gap-default\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-100 elementor-top-column elementor-element elementor-element-f26141a\" data-id=\"f26141a\" data-element_type=\"column\" data-e-type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-7dbf159b elementor-widget elementor-widget-heading\" data-id=\"7dbf159b\" data-element_type=\"widget\" data-e-type=\"widget\" data-widget_type=\"heading.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<h2 class=\"elementor-heading-title elementor-size-default\">Una nueva herramienta integra informaci\u00f3n gen\u00e9tica, molecular y espacial para comprender mejor la organizaci\u00f3n de los tejidos.<\/h2>\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t<section class=\"elementor-section elementor-top-section elementor-element elementor-element-5f0ae8a elementor-section-boxed elementor-section-height-default elementor-section-height-default wpr-particle-no wpr-jarallax-no wpr-parallax-no wpr-sticky-section-no wpr-equal-height-no\" data-id=\"5f0ae8a\" data-element_type=\"section\" data-e-type=\"section\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-container elementor-column-gap-default\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-100 elementor-top-column elementor-element elementor-element-13fc1e05\" data-id=\"13fc1e05\" data-element_type=\"column\" data-e-type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-117ff65a elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"117ff65a\" data-element_type=\"widget\" data-e-type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<p>Las tecnolog\u00edas de <strong>multi\u00f3micas espaciales<\/strong> permiten observar c\u00f3mo las mol\u00e9culas, como genes y prote\u00ednas, se distribuyen dentro de los tejidos biol\u00f3gicos. Estos avances generan grandes vol\u00famenes de datos que, hasta ahora, eran dif\u00edciles de integrar y comparar debido a la diversidad de m\u00e9todos y escalas utilizadas. Para responder a este reto, investigadores de la Universidad de Boston y la Facultad de Medicina Icahn en Mount Sinai desarrollaron <strong>Giotto Suite<\/strong>, una plataforma que organiza y armoniza estos datos de manera flexible y accesible. El estudio fue publicado en <a href=\"https:\/\/www.nature.com\/articles\/s41592-025-02817-w\"><em>Nature Methods<\/em><\/a><em>.<\/em><\/p><p>\u201cHemos desarrollado esta herramienta teniendo en cuenta la escalabilidad, para adaptarse al creciente tama\u00f1o y complejidad de los conjuntos de datos espaciales. Nuestro objetivo era desarrollar una plataforma que ayudara a otros investigadores a descubrir nuevos conocimientos a partir de sus datos espaciales\u201d, afirm\u00f3 el coautor principal, el Dr. Ruben Dries, profesor adjunto de Medicina, Hematolog\u00eda y Oncolog\u00eda M\u00e9dica en la Facultad de Medicina en la Universidad de Boston.<\/p><p>Giotto Suite est\u00e1 dise\u00f1ado como un conjunto modular de paquetes en el lenguaje R, enfocados en el an\u00e1lisis, la integraci\u00f3n y la visualizaci\u00f3n de datos multi\u00f3micos. Su caracter\u00edstica central es que es agn\u00f3stico a la tecnolog\u00eda, lo que significa que puede trabajar con informaci\u00f3n generada por distintas t\u00e9cnicas, como transcript\u00f3mica espacial, prote\u00f3mica e im\u00e1genes de tejidos. \u201cSi bien las tecnolog\u00edas \u00f3micas espaciales est\u00e1n generando datos incre\u00edblemente ricos sobre el panorama molecular de los tejidos, el verdadero desaf\u00edo ahora radica en analizar e interpretar esos datos\u201d, explic\u00f3 el coautor principal, el Dr. Guo-Cheng Yuan, profesor de Gen\u00e9tica y Ciencias Gen\u00f3micas en Icahn.<\/p>\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t<section class=\"elementor-section elementor-top-section elementor-element elementor-element-7033c873 elementor-section-boxed elementor-section-height-default elementor-section-height-default wpr-particle-no wpr-jarallax-no wpr-parallax-no wpr-sticky-section-no wpr-equal-height-no\" data-id=\"7033c873\" data-element_type=\"section\" data-e-type=\"section\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-container elementor-column-gap-default\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-50 elementor-top-column elementor-element elementor-element-2063036\" data-id=\"2063036\" data-element_type=\"column\" data-e-type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-325bb72e elementor-widget elementor-widget-image\" data-id=\"325bb72e\" data-element_type=\"widget\" data-e-type=\"widget\" data-widget_type=\"image.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<img fetchpriority=\"high\" decoding=\"async\" width=\"1200\" height=\"630\" src=\"https:\/\/saluddigital.com\/wp-content\/uploads\/2025\/10\/10-25-06.jpg\" class=\"attachment-full size-full wp-image-60527\" alt=\"\" srcset=\"https:\/\/saluddigital.com\/wp-content\/uploads\/2025\/10\/10-25-06.jpg 1200w, https:\/\/saluddigital.com\/wp-content\/uploads\/2025\/10\/10-25-06-660x347.jpg 660w, https:\/\/saluddigital.com\/wp-content\/uploads\/2025\/10\/10-25-06-840x441.jpg 840w, https:\/\/saluddigital.com\/wp-content\/uploads\/2025\/10\/10-25-06-768x403.jpg 768w, https:\/\/saluddigital.com\/wp-content\/uploads\/2025\/10\/10-25-06-18x9.jpg 18w\" sizes=\"(max-width: 1200px) 100vw, 1200px\" \/>\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-50 elementor-top-column elementor-element elementor-element-6806adf7\" data-id=\"6806adf7\" data-element_type=\"column\" data-e-type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-3429f827 elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"3429f827\" data-element_type=\"widget\" data-e-type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<p>La herramienta introduce estructuras de datos innovadoras capaces de representar desde la ubicaci\u00f3n de una sola mol\u00e9cula dentro de una c\u00e9lula hasta la arquitectura completa de un tejido. Esto facilita estudios a nivel subcelular, celular y tisular, lo que permite entender c\u00f3mo interact\u00faan las distintas capas de informaci\u00f3n biol\u00f3gica.<\/p>\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t<section class=\"elementor-section elementor-top-section elementor-element elementor-element-1fe766c3 elementor-section-boxed elementor-section-height-default elementor-section-height-default wpr-particle-no wpr-jarallax-no wpr-parallax-no wpr-sticky-section-no wpr-equal-height-no\" data-id=\"1fe766c3\" data-element_type=\"section\" data-e-type=\"section\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-container elementor-column-gap-default\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-100 elementor-top-column elementor-element elementor-element-4ebe0708\" data-id=\"4ebe0708\" data-element_type=\"column\" data-e-type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-2a43519c elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"2a43519c\" data-element_type=\"widget\" data-e-type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<p>\u201cEl mayor obst\u00e1culo ya no es generar la informaci\u00f3n, sino darle sentido. Los bi\u00f3logos necesitan herramientas que puedan seguir el ritmo de la creciente complejidad y escala de estos conjuntos de datos y les ayuden a extraer conclusiones significativas. Quer\u00edamos crear una herramienta que no solo simplificara el proceso de an\u00e1lisis, sino que tambi\u00e9n se adaptara a diferentes tipos de datos espaciales y flujos de trabajo, para que los investigadores pudieran centrarse en la ciencia en lugar de en los obst\u00e1culos t\u00e9cnicos\u201d, detall\u00f3 el Dr. Yuan.<\/p><p>Entre sus principales aportes destacan:<\/p><ul><li><strong>Integraci\u00f3n multimodal<\/strong>: combina datos de ARN, prote\u00ednas, epigen\u00e9tica y morfolog\u00eda en un solo marco de an\u00e1lisis<\/li><li><strong>Escalabilidad<\/strong>: puede manejar bases de datos masivas, con millones de c\u00e9lulas y transcripciones, gracias a t\u00e9cnicas de c\u00e1lculo en paralelo y almacenamiento optimizado<\/li><li><strong>Interoperability<\/strong>: se conecta con herramientas ampliamente usadas en biolog\u00eda computacional y ciencias geoespaciales, lo que favorece la colaboraci\u00f3n y el desarrollo de nuevos m\u00e9todos<\/li><li><strong>Interactividad<\/strong>: incluye aplicaciones visuales que permiten explorar y anotar regiones de inter\u00e9s en tejidos, incluso en tres dimensiones\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0<\/li><\/ul><p>Giotto Suite ya ha sido probado en datos de c\u00e1ncer de mama, cerebro de rat\u00f3n y am\u00edgdalas humanas, demostrando su capacidad para detectar patrones complejos de organizaci\u00f3n celular. Los autores destacan que este ecosistema ser\u00e1 clave para iniciativas internacionales que buscan construir atlas celulares y tisulares a gran escala, fundamentales para entender procesos de salud y enfermedad.<\/p><p>El desarrollo de Giotto Suite representa un avance en el campo de la bioinform\u00e1tica aplicada a la biolog\u00eda espacial. Contar con marco unificado, escalable y abierto, permitir\u00eda acelerar descubrimientos sobre c\u00f3mo se estructuran y funcionan los tejidos, con posibles aplicaciones en investigaci\u00f3n biom\u00e9dica, diagn\u00f3stico y terapias personalizadas.<\/p>\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t<section class=\"elementor-section elementor-top-section elementor-element elementor-element-3a04d53 elementor-section-boxed elementor-section-height-default elementor-section-height-default wpr-particle-no wpr-jarallax-no wpr-parallax-no wpr-sticky-section-no wpr-equal-height-no\" data-id=\"3a04d53\" data-element_type=\"section\" data-e-type=\"section\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-container elementor-column-gap-default\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-100 elementor-top-column elementor-element elementor-element-797e03e6\" data-id=\"797e03e6\" data-element_type=\"column\" data-e-type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-6cd9d6c5 elementor-widget elementor-widget-toggle\" data-id=\"6cd9d6c5\" data-element_type=\"widget\" data-e-type=\"widget\" data-widget_type=\"toggle.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-toggle\">\n\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-toggle-item\">\n\t\t\t\t\t<div id=\"elementor-tab-title-1821\" class=\"elementor-tab-title\" data-tab=\"1\" role=\"button\" aria-controls=\"elementor-tab-content-1821\" aria-expanded=\"false\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<span class=\"elementor-toggle-icon elementor-toggle-icon-left\" aria-hidden=\"true\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<span class=\"elementor-toggle-icon-closed\"><i class=\"fas fa-caret-right\"><\/i><\/span>\n\t\t\t\t\t\t\t\t<span class=\"elementor-toggle-icon-opened\"><i class=\"elementor-toggle-icon-opened fas fa-caret-up\"><\/i><\/span>\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/span>\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<a class=\"elementor-toggle-title\" tabindex=\"0\"> BIBLIOGRAPHY<\/a>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\n\t\t\t\t\t<div id=\"elementor-tab-content-1821\" class=\"elementor-tab-content elementor-clearfix\" data-tab=\"1\" role=\"region\" aria-labelledby=\"elementor-tab-title-1821\"><p><strong>MOUNT SINAI<\/strong><\/p><p><a href=\"https:\/\/www.mountsinai.org\/about\/newsroom\/2025\/new-software-tool-aims-to-help-scientists-better-analyze-complex-spatial-data-from-tissues\">https:\/\/www.mountsinai.org\/about\/newsroom\/2025\/new-software-tool-aims-to-help-scientists-better-analyze-complex-spatial-data-from-tissues<\/a><\/p><p><strong>NATURE<\/strong><\/p><p><a href=\"https:\/\/www.nature.com\/articles\/s41592-025-02817-w\">https:\/\/www.nature.com\/articles\/s41592-025-02817-w<\/a><\/p><\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t<\/div>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>La Giotto Suite, desarrollada por cient\u00edficos de Mount Sinai, es un ecosistema para analizar datos espaciales de m\u00faltiples escalas y tecnolog\u00edas.<\/p>","protected":false},"author":1,"featured_media":60527,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[156,160],"tags":[145],"class_list":["post-60525","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-big-data","category-noticias","tag-noticias"],"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/saluddigital.com\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/60525","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/saluddigital.com\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/saluddigital.com\/en\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/saluddigital.com\/en\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/saluddigital.com\/en\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=60525"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/saluddigital.com\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/60525\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/saluddigital.com\/en\/wp-json\/wp\/v2\/media\/60527"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/saluddigital.com\/en\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=60525"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/saluddigital.com\/en\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=60525"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/saluddigital.com\/en\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=60525"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}